Comparative transcriptomic analysis reveals signatures of selection for orb-weaving behavior in spiders
本論文は、98 種のクモのゲノムを用いた比較トランスクリプトーム解析により、正の選択や緩和された選択、遺伝子コピー数の変化などの遺伝的シグナルを特定することで、円網（オーブ）を編む行動の進化起源に関する競合する仮説を解明し、複雑な行動の出現メカニズムに新たな洞察をもたらした。
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evolutionary biology
451 件の論文
Mating Systems and Evolutionary Rescue
個体ベースのモデルを用いた本研究は、配偶システムが環境変化に対する適応と絶滅リスクに与える影響を明らかにし、集団サイズによって配偶選択が「遺伝子多様性の喪失」を加速して絶滅リスクを高めるか、あるいは「優良遺伝子の固定」を促進して進化的回復を助けるかが決まることを示しました。
An abstract model of nonrandom, non-Lamarckian mutation in evolution using a multivariate estimation-of-distribution algorithm
この論文は、推定分布アルゴリズムの枠組みを用いて、突然変異がランダムでもラマルク主義でもないが、世代を超えてゲノム内に蓄積する情報に影響されるという「相互作用に基づく進化（IBE）」の理論を実証するシミュレーションモデルを提示し、進化理論と進化計算における情報の内部的統合の重要性を浮き彫りにしています。
A conserved enhancer cluster regulates efnb2 expression in the vertebrate dorsal retina
この論文は、四眼魚などの脊椎動物を用いた研究により、背側網膜の EFNB2 遺伝子発現を制御する保存されたエンハンサークラスターを同定し、そのヒトにおける網膜厚さの遺伝的変異との関連性を明らかにしたことを報告しています。
Flexible Asexuality: Naturally occurring variation in mechanisms of parthenogenesis within lineages and individuals of a facultative parthenogen, Megacrania batesii
本論文は、単為生殖を行う昆虫メガクラーニア・バテシーにおいて、個体や系統間で単為生殖のメカニズムに大きな変異が存在し、それが遺伝的多様性の維持に重要な役割を果たしていることを明らかにした。
Evolutionary persistence of a highly prevalent multicopy mitochondrial-derived nuclear insertion (Mega-NUMT) in Neotropical Drosophila flies
本研究は、長読長配列シークエンシング技術を用いて、ネオトロピカルハエ（Drosophila paulistorum）の核ゲノムに約 60 個のミトコンドリアゲノムがクラスター化して存在する「Mega-NUMT」を初めて発見し、これが種分化以前に核へ転入され、平衡選択によって自然界で高頻度に維持されてきたことを実証したものである。
Single cell sequencing during the entire life cycle reveals cell type diversity in Oikopleura dioica, and pools of genes expressed in the house-producing epithelium
本論文は、単細胞シーケンシングを用いてホヤ類のオキレオラ・ディオイカ（Oikopleura dioica）の全生活環を解析し、濾過摂食に不可欠な「家」を生成する特殊な上皮細胞の多様性、発生過程、およびその形成を制御する遺伝子プールを解明したものである。
Using herbarium genomics to understand the history of a global plant invasion
植物標本を用いたゲノム解析により、セイタカアワダチソウ（Reynoutria 属）の日本由来の侵入経路、200 年にわたる遺伝的多様性の低下、および交雑種（R. x bohemica）の形成過程と長期的な無性繁殖による広域拡散のメカニズムが解明されました。
Mitonuclear interactions shape male cuticular hydrocarbon profiles with consequences on mating success
この研究は、ショウジョウバエにおいて核とミトコンドリアのゲノム間の相互作用が雄の性フェロモン（クチクラ炭化水素）のプロファイル形成に影響を与え、その適合性が雌の配偶者選択と繁殖成功を決定づけることを示しました。
Regression of juvenile tentacles is driven by loss of cell proliferation in Haliclystus sanjuanensis, a cnidarian with limited metamorphosis
この論文は、イソギンチャク類の一種である Haliclystus sanjuanensis において、幼生期の触手が細胞分裂の停止により退縮し、成体の触手や付着器官の形成に細胞資源が転用されることで、完全な変態を伴わずに成体の体構成を確立するメカニズムを明らかにしたものである。
Evolution of recombination suppression and sex determination on Y chromosomes of the plant genus Mercurialis
本論文は、長リード配列ゲノム解析などを用いて植物属 Mercurialis の Y 染色体における再結合抑制が 2 つの段階で進化し、その中で APRR7 遺伝子がマスター性決定遺伝子の有力候補であることを明らかにしたものである。
Meso-structural domains, not aggregated networks, reveal the action of structural selection
集約されたネットワーク解析では見逃されてきた構造的選択の作用は、階層的なメソ構造ドメインに焦点を当てることで初めて検出可能となり、進化の勾配を明らかにする。
Bacterial ancestry of the mitochondrial ATP exporter
本研究は、ミトコンドリアの ATP 輸送体である AAC が、以前は存在が知られていなかった細菌由来の CysZ や YihY と構造的・機能的な相同性を持つことを発見し、ミトコンドリアの ATP 輸出機構が真核生物の革新ではなく細菌に起源を持つことを明らかにした。
Unilateral cross-feeding constrains adaptive evolution, even in the producer without direct fitness effects.
片方向の栄養供給（クロスフィーディング）相互作用は、直接的な適応度の利益が一方にしか存在しない場合でも、微生物群集における両種の適応進化を制限し、純粋培養に比べて自然選択の圧力を強めることが示された。
Estimating Bayesian phylogenetic information content using geodesic distances
この論文は、事前分布と事後分布からサンプリングされた系統樹の相分散比に基づき、地測距離を用いて系統樹空間におけるベイズ的系統情報量を推定する新たな手法を提案し、その有効性をシミュレーションおよび実データで示したものである。
Endosymbiotic algal photosynthesis shapes diel transcriptome architecture in its ciliate host Paramecium bursaria
光合成を行う共生藻が、宿主である繊毛虫パラメシウム・ブルサリアの日内転写プログラムを再編成し、そのリズムを支配する主要な組織者として機能していることが、光合成阻害実験や近縁種の比較を通じて明らかになった。
Bridgehead invasions of ambrosia beetles are structured by inbreeding and hybridisation
この研究は、世界中に侵入したコナラキクイムシの複合体において、橋頭堡からの侵入が遺伝的負荷を蓄積させる一方で、異なる系統間の交雑が有害変異の除去を助ける可能性を示し、特に南アフリカで見られる遺伝的多様性が低い単一系統と、それと交雑した第二系統の遺伝的パターンを解明したものである。
Population genomics reveal genetic variants associated with lunar-regulated spawning time in grass puffer
本論文は、イボイワシの日本沿岸における月齢に同期した産卵時刻の地理的変異が、自由走行リズム周期（τ）の差と、その周期を調節する候補遺伝子 prrt1l の変異によって説明されることを、集団ゲノム解析と機能検証を通じて明らかにしたものである。
Limited genetic structure and high gene flow in Fasciola hepatica populations infecting ruminants in different geographic areas in the UK
この研究では、イギリスの異なる地域で反芻動物を感染させる Fasciola hepatica（肝吸虫）の集団において、家畜の移動や寄生虫の適応によって促進される高い遺伝子流動が確認され、地理的な構造が限定的であることが、高スループットシーケンシングを用いた解析から明らかになりました。
Entangled adaptive landscapes facilitate the evolution of gene regulation by exaptation
本研究は、大腸菌の転写因子結合部位が、個々の適応的な変異を積み重ねることで滑らかな適応度地形を介して別の転写因子の結合部位へと進化する（前適応する）ことを実証し、その過程で生じる転写クロストークが遺伝子制御の多様化に重要であることを示しました。